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在微信上注册小程序商家店铺的步骤如下。
1、打开微信，搜索并关注“微信商家助手”公众号。
2、在公众号的底部菜单栏里，点击“商家入驻”，然后选择“商家注册”，进入注册页面。
3、选择要开通的商家主体类型，企业注册选择“企业注册”，个人注册选择“个体工商户注册”，填写包括联系方式、密码等基本信息后，点击提交，如果使用企业账号注册，还需要提供营业执照扫描件和账户信息，如果选择个体工商户注册，则需要提供个人身份证照片和相关信息。
4、注册成功后，使用注册的账号登录微信商家平台，第一次登录需完善商家信息并补充相关资质证明，这些信息包括商家的基础信息、经营类目及资质证明等，提交这些信息后等待审核即可，审核通过后，即可在微信上成功注册小程序商家店铺。
具体的流程和所需材料可能会因微信版本更新或政策变化而有所不同，建议根据实际情况进行操作，如有疑问，可咨询微信客服获取帮助。